Lol, venía a comentar varios errores, pero la mayoría ya los dijo Elessar :P
Bueno, además de todo lo que él ya dijo, está el hecho de que no me deja evolucionar a mi Treecko. Pasa que cuando sube a nivel 16, aparece la animación y todo de que Treecko está evolucionando, pero luego deja de evolucionar con el diálogo de "Uh?...", como si hubiera apretado el botón B para cancelar la evolución, cuando no aprieto nada.
Hay un error en el centro Pokémon del Puerto Valencia, la esquina superior del edificio es atravesable y el Overworld del personaje queda por sobre el edificio al atravesarlo. También, en la entrada del Puerto Valencia, hay un arbusto (de los pequeños circulares que ocupan un tile) que es atravesable.
En el bosque Pureza, en el rincón cerca de la entrada que lleva a Puerto Valencia, donde se encuentra el Youngster que te dice algo así como que le gusta luchar y atrapar Pokémons, los árboles de la última fila (demás atrás) son atravesables.
Respecto a lo que dijo Elessar de que la Prof. Ivy no camina sino que se desliza me había dado cuenta yo también, pero supongo que será porque no has hecho los demás minis del personaje (lo mismo pasa con la primer lider, Sissy).
Falta aún cambiar el WorldMap, ya que sigue estando el de Kanto, además de cambiar como bien dijo Elessar el backsprite de Red.

Por cierto, me he capturado a todos los Pokémons disponibles en el Alfa hasta ahora: Pidgey, Spearow, Wingull, Cubone, Weedle, Caterpie, Metapod, Kakuna, Aipom y Shroomish y Treecko, además de Pikachu y Lapras claro.
Me gusta como va. En cuanto a los gráficos que has cambiado, me encantan los nuevos tiles de CP y Tienda, además de que combinan muy bien con el estilo original de FR. También se nota que cambiaste los sprites de Pikachu, me gustan los nuevos (No sé de donde los sacaste, porque creo que no pertenecen a ningún juego de NDS) aunque son muy grandes, pero no creo que molesten en absoluto (aunque hay que hacer la versión femenina también, que mi Pikachu me tocó hembra y no tiene la cola cambiada :P). También me gusta bastante el sprite nuevo del PokeFriki, creo que no lo vi antes. También me encanta el sprite de Red en la introducción, pero no me agradan ni el Overworld ni el sprite de batalla (el de la tarjeta de entrenador). Además, el mini tiene un error en la gorra. Verás, la bisera está echada para atrás, pero el resto sigue igual; la parte blanca sigue adelante y el agujero de la gorra sigue atras. La gorra se da vuelta completa hombre xD Además, como dijo Elessar, el sprite tiene la gorra para adelante y el mini para atrás, creo que deberías hacerlo de una sola forma en todos los sprites.
Respecto a la historia creo que avanza muy rápido, teniendo en cuenta los pocos gimnasios que son he llegado y derrotado bastante rápido al primer Líder. No sé si era así en el Arcoiris original ya que nunca lo he jugado, jugué al Naranja (varias veces), pero nunca al Arcoiris. Podrías hacer más laberíntico el Bosque Pureza, que está muy fácil de pasar. También me resultan muy pequeños y vacíos los pueblos que hay hasta ahora.
Como sea, de todas maneras por ahora va genial, es increíble que esto sea recién el Alfa, espero como siempre ansioso la beta.