Vale, si no me equivoco, con la primera pregunta te refieres a cómo cambiar los exteriores. Para eso debes modificar el bloque, que te aparece justo encima de los tilesets cuando mapeas. Si te das cuenta, hay un cuadrado de 2x2 en el que normalmente están unos árboles. Simplemente tienes que modificar eso.

En cuanto a la segunda pregunta, el problema es que al insertar otro tile las paletas cambian, por lo que tienes que guardar la paleta de nuevo e insertar los tiles otra vez.