No, es que tu emulador ha de estar mal XD
A mi me pasa cuando le ando picando y picando. Pero realmente no se porque sucede, pero la solucion que yo tengo es sencilla:
Ve a la carpeta donde esta tu emulador y borra el archivo vba.ini. Si hay otros llamados vba1.ini o vba2.ini, o con otros numeros, borralos tambien.
Ahora entra de nuevo a tu emulador y compruébalo. Eso si, si tenías las teclas configuradas de otra manera vas a tener que configurarlas de nuevo, pero no creo que haya mayor problema con eso.
¡Saludos!