Imagino que no estás insertando los tiles correctamente. Deberías leerte algún manual sobre el tema: en el subforo tutoriales hay muchos. Creo que el tutorial de War para insertar tiles te solucionaría ese problema de las paletas: http://wahackforo.com/t-Tutorial-de-Insertar-tiles-con-sus-Colores-Originales Sigue los pasos que dice War y, si aún tienes algún problema, no dudes en preguntar =)

Por cierto... cada vez que uses el editor de bloques de Advance Map, guarda, abre otro mapa que use un tileset diferente del que acabas de editar (en tu caso, por ejemplo, abre un mapa de FORTREE CITY), y luego vuelve a cargar tu mapa. A veces el block editor da errores y eso sirve para evitarlos.