te voy a reponder en orden a tus loreguntas:
1: Depende de para qué. El pokemon ruby tiene mas herramientas compatibles y es mas facil cambiar cosas en el, por ejemplo la portada, etc... En pokemon fire red tienes de ventaja que los mapas son mas extensos, es decir, hay mas espacio para cambiarlos a tu gusto.
2:Tienes links de todas estas herramientas en la pagina principal de wah, o sino busca por el foro packs de herramientas de gente que lo sube, y de ahi lo puedes sacar.
3: Depende. Piensa en cómo va a ser tu juego, la historia, etc. Si por ejemplo, piensas hacer la historia con pokemon legendarios, como Reshiram, Arceus, etc. podrías meterlos en tu rom. No es dificil hacerlo; puedes encontrar el pack de advance series en uno de los foros de wah.
Por lo demas no puedo ayudarte, porque no tengo mjucha idea en insertar tiles :S
Espero haberte ayudado.