Lo del script te lo contestará en breve Mew2, lo del PET y la dex, te lo contesto yo.

1. El pet esta muy bien, pero como tu has dicho es rustico y lleno de Bugs, existe una herramienta con muy parecida interfaz llamada Advance Trainer.

2. El Pokedex Order Editor creo recordar que fue ampliado a R/S/E, pero hablo sin saber, mira este tuto para cerciorarte: http://wahackforo.com/t-Cambiando-Orden-en-la-Pok%C3%A9Dex?highlight=dex

Salu2.