Lo que hacen es dar un efecto dependiendo del ambiente que sea supongamos hay para bosques (se ven sombras de hojas y el ambiente es mas oscuro de lo habitual) nubes (se ven sombras de nubes xd) y muchas mas
para configurarlas mira este tutorial
http://wahackforo.com/t-tutorial-efecto-sombra-de-nubes
y aqui te dejo un par de fogs jeje
Y para el agua hay dos uno es el "6" qeu es para el agua con reflejo y el otro es el "7" que es agua de surf (el 6 tambien sirve para surf pero con efecto de reflejo)}
y los autotiles busca en google hay muchos, un consejo, google busca por palabras clave (algo que no muchos detectan no se tu caso, al menos la gente que e conocido xd) supongamos pone "Autotiles pokemon HG SS" o "autotiles pokemon essentials" solo es cosa de saber que poner y te saldran las soluciones, yo tengo varios autotiles de Black and white y HG SS