A ver, vayamos por puntos.
1. En RPG Maker se puede insertar música en MP3, por lo que no hay que pasarlo a MIDI.
2. La música se loopea sola. Lo único que tienes que hacer es ponerle la música al mapa:
Espero que te haya servido de ayuda, yo he estado exactamente lo mismo que tú estos días jajaja
EDIT: Lo han contestado un poco antes xDD