Pues mira, es lo mismo, es todo cuestión de tu iniciativa, la parte más dura de un Hack Rom de cualquier base, o, incluso, de crear un Juego, son las ideas, una vez que tienes esas ideas, te preguntas ¿Que base uso, si quiero X cosa? ¿Puedo hacerlo en todas las bases?
Prácticamente, todo lo que se hace en una base, se puede hacer en otra, menos, por ahora, (No por mucho de hecho) insertar más pokémons sin borrar los existentes (En PC se trabaja en ello) en GBA.
Ahora, bien, Chamber enlistó las ventajas y desventajas, las ventajas me parecen muy bien, pero voy a hacer una revisión con mi opinión de las desventajas... (Espero que no te moleste [MENTION=26330]Chamber[/MENTION])
Desventajas:
-Se que entre tus objetivos esta sobresalir, dificil en GBA. (Ésta es cierta, es más dificil sobresalir, pero al mismo tiempo más desafiante, ya que hay más competencia)
-GBC a mi punto de vista vende mas que GBA. La nostalgia es una gran mercadotecnia. (Nada que decir, totalmente a favor)
-Satisfaccion. Tu y yo sabemos lo que se siente hacer cosas nuevas en GBC, desde un sprite hasta una modificacion de una mecanica de juego. No significa que en GBA no las hagas, pero serias un pez gordo en un gran estanque. (Si bien no quito mérito de que hay cosas complicadas en GBC, a la hora de querer detacar y hacer algo original, siempre tendrás problemas... Por más herramientas que halla, insertar una Anim con Wind7 es todo un desafío, hacer una rutina ASM innovadora no es nada fácil, etc)
-Comunidad. Estas a la cabeza del movimiento GBC ahorita y tus contribuciones son reconocidas. ( - )(Añado a éste punto, que en GBA, la comunidad Hispana en general siempre te va a decir "Cambia los Gráficos" "Cámbia ésta paleta" "Cambia aquella")
-Tiles, Mapas?? quien los necesita con una buena historia y buenos scripts. (Como dije, en GBA tampoco necesitas grandes tiles, ni hermosos mapas... pero parece que si no tienes graficas, por aquí nadie quiere tu hack)
-Perderas Fans. Gran cantidad de usuarios que te siguen es por la Base. (Quizás, pero gran parte por las innovaciones)
-Por ultimo, tu y to sabemos lo frustrante que es querer realizar "algo" en GBC y no poder hacerlo, mirar a los GBAsianos del foro y darnos cuenta de que ellos pueden con un click por que hay mas herramietas, informacion y mayor numero de usuarios, pero venga, apoco no sientes ese gran orgullo cuando abres la primera pagina de tu tema? al ver los mapas, los graficos, la historia, TODO y TIEMPO que le has inverdo? apoco no sientes una gran satisfaccion?? (Como ya dije, no digo que GBC sea sencillo, ni mucho menos, pero tampoco hay tanta diferencia a la hora de hacer las cosas bien) (Además, si te gusta GBA, y los desafíos, Emerald o Esmeralda, siempre son grandes Rom Para jugar un rato :3 )
Otra cosa que eh de decir, es que quizás puedas intentar ésto: Hacer el juego en ambas bases, te cansarás de una tarde o temprano y te quedas con la otra.
Ah! Y eh visto un proyecto en particular que empezo en GBA, se paso a GBC, luego a GBA, luego a RPG Maker, luego a Sphere, y ahora creo que a su propio codigo C# xD
(Pokémon Manathian o algo así de Ray Laé Àlfori, a.k.a. Marajath, a.k.a. como se llame ahora en DA xD)