Para mí, ambas cosas son iguales, en tanto sentido si usarlas o no. Me decanto por el Rom Hacking ya que me llama más la atencion y el factor de desafio que éste incluye me parece mas entretenido (Aquí abajo pueden leer que considero que ambas plataformas tienen un factor de desafío, pero distinto)

Yo comparo así ambas cosas:

Desafios

Rom Hacking: Capacidades mucho más limitadas, se basa en crear tu juego a partir de uno ya existente, usando parte de su código y modificándolo cuanto sea necesario. Para destacar necesitas tener conocimiento en varios campos y tener novedades incluidas, para las cuales puedes usar el código base de la GBA (Véase ASM) o, en el PokéHacking el código de programación interno de la Rom (Véase Scripts)

RPG Maker: Capacidades casi infinitas, se basa en usar éste programa para crear tu juego. El gran desafio es aprovechar esas capacidades al máximo potencial y calidad, además de hacer algo que sea novedoso para que pueda destacar entre los demás de su misma clase. Para destacar es necesario saber el código base en el que está programada ésta plataforma y desarrollar sus propias funciones extras.

Caracterísitcas:

Rom Hacking: Uso de colores, gráficas, procesamientos, limitados. Gran espacio de almacenamiento de datos, debido a que éstos deben estar dentro de las características; aún así, no es infinito ni mucho menos cercano a 1gb.

RPG Maker: No dispone de grandes limitaciones. Espacio infinito de almacenamiento de datos. Puede reproducir sonidos, películas/videos, mostrar colores y gráficas de distinta índole al mismo tiempo.

Sistemas de Programación / Scripteo

Rom Hacking:

Código Interno: ScriptsHexadecimales, se ordenan de forma lineal y se ejecuta una función después de la otra. Se pueden asignar distintos Scripts a distintas partes dentro del mismo juego. (¿Se podría considerar orientado a Objetos?). Tambíen cuenta con condicionales, utiliza variables de tipo enteras y booleanas.

Código Base: Lenguaje ensamblador, lenguaje de bajo nivel, poco amigable con el usuario. Se ordena de forma lineal y puede controlar directamente al Hardware.

RPG Maker:

Scripts: Interfaz grafica para comandos. Forma de hacer eventos sencilla y entendible, con colores para marcar distintas partes del mismo.

Lenguaje base: Ruby Code, lenguaje de alto nivel, amigable al usuario.

En fin, es cuestión de gustos...

PD: No se mucho de Rubycode