Empezamos mal si metes un spoiler del final justo en la primera linea de la sinopsis... Pero bueno, da igual (?) Luego, la trama en si es bastante pobre... Aunque se apoya en una idea original: El Pokémon World, crea un manojo de lazos de familia inexistentes entre personajes reales de la saga, lo cual queda cuanto menos forzado. Te recomiendo para empezar crear nuevos personajes e incluso un nuevo profesor... Porque no me veo a Elm tratando de matar a Oak y en caso de hacerlo así es necesario darles a personajes oficiales un profundo cambio de personalidad. Vamos, que considero que te sería más fácil inventar tus propios protagonistas y secundarios. Aún así la elección es tuya y te deseo suerte en ella.

Luego, el mapa mostrado es bastante bueno en el sentido de que no te limitas a usar el Pueblo Paleta de toda la vida sino que lo amplias. Aún así hay fallos como en el paso de la parte izquierda a la derecha del poblado, donde los caminos se cortan de forma inexplicable y tienes un árbol a medio hacer. Por otro lado me gusta el textbox y el mini del protagonista.

Sobre las ideas... Estas dos merecen ser mentadas:

"No abra Pokemon del mismo nivel en todas las rutas (Ejemplo:En Ruta 1 Habra Pokemon Lvl 3 y también habrá uno en Lvl 30 que Seria el Lider de manada)."

Bueno idea... Para un juego en el que el jugador pueda distinguir los enemigos en el mapa. En un juego de encuentros aleatorios esto desequilibraria el gameplay de forma alarmante. Imagínate encontrarte de pura casualidad a la criatura a nivel 30 estando al 5... No puedes escapar ni ganar... Ergo es una derrota segura. La idea no es mala pero tienes que plantearla de otra manera... Por ejemplo que estos líderes de manadas se vean en el mapa y no aparezcan aleatoriamente en la hierba.

"Rutas Subterráneas para ir a Cualquier Ciudad en un Segundos."

Brillante... De no ser porque le quitas toda su utilidad a vuelo. Si las conexiones fueran entre rutas alejadas de las grandes ciudades el sistema resultaría más interesante... A fin de cuentas a no ser que planees omitir vuelo o no darlo hasta cerca del final este sistema quedaría inútil una vez conseguida la MO.

Las demás ideas son correctas sin más. Bueno, es un buen inicio lleno de buenas intenciones... Solo te falta depurar los detalles. Muchísima suerte.