eso solo seria factible si haces que acabes en un mapa que sea exactamente el mismo i en el mismo sitio que la "segunda parte" y creo que daría infinitos errores aparte que lo de los pokemons seria muy difícil ya que tendrías que mover la tabla de los pokes i ampliarla casi el triple, crear cada pokemon con sus datos sus sprites en cada parte de tu hiper juego XD
casi mejor solo haz una región i una historia ya que a la hora de la verdad muy pocos hacks acaban echos enteros (que se pueda decir que están al 100%) y mas si esperas hacer 2 o mas partes XD