Ya sabía que no eras tonto! xD
Si te refieres al tileset(donde vienen todos los tiles, que se extrae desde el A-map) debes guardarlo en el formato que te viene, despues de insertar los tiles nuevos.
Si te refieres a los tiles nuevos solo, yo los guardo en PNG, después de indexarlos y ver si tiene 15 colores+fondo.
Si no te sale, dímelo por perfil, que así evitamos problemas.