Puesss en el mundo del hacking siempre hay riesgos, solo hay que saber evitarlos xD
Bien, primero, no, por compilar un mismo script varias veces no pasa nada, si ocurre algo, ocurrira la 1º vez ke lo compiles, es decir, si compilas un script y lo haces bien las siguientes 2000 veces ke lo vuelvas a compilar sera lo mismo.
Te recomiendo usar la herramienta FSF para buscar espacio libre en el rom (descargable en la web de wah) o tambien puedes escribir un offset en XSE y abrirlo antes de hacer nada para ver si esta vacio o si ya contiene datos.
Antes de usar cualquier direccion para un script, conversacion o movimiento asegurate de que es una direccion limpia.
Te recomiendo usar direcciones a partir de 800000 para arriba, que hay mucho espacio libre. (a no ser que tu rom sea esmeralda, en tal caso te aconsejo ke empiezes por la 900000)
Bueno mas o menos espero que lo hayas entendido, si algo no te kedo claro, azmelo saber.