A ver, para jugar juegos en formato .ips debes bajarte una herramienta que se llama Lunar IPS. Una vez la has descargado sigue este tutorial.

Para lo de la Pokédex, si trabajas en FireRed/LeafGreen descarga la herramienta Pokédex Order Editor, que sirve para cambiar el orden de los Pokémon en la Pokédex. Si trabajas en Ruby/Sapphire o en Emerald, no sé si hay alguna.

Espero haberte ayudado!

That's all,

Plup!