El pause es un comando muy útil que yo uso bastante. Como bien dices, sirve para hacer una pausa en el script y, aproximadamente, 0x25 equivale a un segundo, pero es cuestión de ir probando y buscar exactamente lo que quieres.
Y las flags libres no sé exactamente cuales son, pero siempre he usado de 1200 hacia arriba, que a partir de allí todas están libres.
En el XSE hay una lista en Ayuda-Guia (no puedo decirtelas porque me da error al acceder a la guía, pero sé que están ahí).
Saludos!