Es por el color de los tiles... Coje la paleta de colores con el Advance Map de ese tileset, en el Editor de Bloques, la guardas, la abres con Paint y abres el de la flor, entonces usa esos colores para ponerlos en la flor, te tendría que resolver el problema. Si no entiendes algo dilo.
Las paletas las puedes cambiar desde el Advance Map. De la siguiente manera:
Para ello, has de ir al Editor de Bloques, cliqueas en Palettes, luego a Show Palette Editor, y ahí puedes cambiar los colores de las paletas.
Si lo que quieres es cambiar directamente desde el tileset. Haz esto:
En el Editor de Bloques, le das clic en Imagen, después a Guardar Tileset 1, o Guardar Tileset 2, depende de donde tengas la flor. Entonces recuerda donde la has guardado. Luego la abres con Paint, y usa el tubito ese transparente que sirve para coger colores de donde sean y usarlos en Paint. Entonces, coges el color de otra parte del Tileset, por ejemplo de la hierba, y se lo pones en la flor, y así sucesivamente hasta que la tengas con los colores de la paleta original. Que en este caso, al ser la flor, sería el verde, que es la Palette0