Las paletas las puedes cambiar desde el Advance Map. De la siguiente manera:
Para ello, has de ir al Editor de Bloques, cliqueas en Palettes, luego a Show Palette Editor, y ahí puedes cambiar los colores de las paletas.
Si lo que quieres es cambiar directamente desde el tileset. Haz esto:
En el Editor de Bloques, le das clic en Imagen, después a Guardar Tileset 1, o Guardar Tileset 2, depende de donde tengas la flor. Entonces recuerda donde la has guardado. Luego la abres con Paint, y usa el tubito ese transparente que sirve para coger colores de donde sean y usarlos en Paint. Entonces, coges el color de otra parte del Tileset, por ejemplo de la hierba, y se lo pones en la flor, y así sucesivamente hasta que la tengas con los colores de la paleta original. Que en este caso, al ser la flor, sería el verde, que es la Palette0