En el XSE abres una nueva pestaƱa, aprietas "Ctrl + O" y busca la carpeta donde tenes el XSE ya abris el archivo que dice:
stdpoke.rbh
Y sobre lo del pokemon es por que no se activa la flag "828"
en un Script antes de release pones esto:
setflag 0x828
Ah, las dudads de Scripts van aca
Consultorio de dudas de Script