No creo que Windows 7 tenga algo que ver, yo tengo Windows 8 y funciona perfectamente,
Cuando ya tengas la imagen que quieras insertar en tu rom de pokemon, vas a la dirección 1635 (chico) 1636 (chica) clickeas en Import, seleccionas la imagen del nuevo entrenador, una vez echo esto, clickeas en Write to Rom y te saldrá un cartel, tildas las opciones así
y pulsas OK y listo, tiene que funcionar, al menos a mi me sirvió a la perfecció, :D
Saludos!