Para cambiar la música del profesor primero tienes que aprender a insertar midis:
Insertar midis | Whack a Hack! - Tutorial-gba

Después tan solo tendrías que encontrar el nombre del tema (que ahora mismo no recuerdo cual es) para cambiarlo.

En cuanto a lo de la portada, puedes leerte este tutorial:
Portadas de Pokémon | Whack a Hack! - Tutorial-gba