Primero que nada no hagas multipost.
Segundo, ¿Te refieres a que si hackeas por ejemplo un PokemonRuby.Gba hackearás los cartuchos o todos los .gba?
Si quieres decir eso te respondo: ¡NO! Hackeas únicamente el archivo que abres con el programa que uses, sea cual sea.
EDIT: No, no es posible hackear un cartucho. Y no, no se hackean todos al hackear uno.