Iniciado por Cabronosaurio
Creo que no te he entendido del todo, explícate mejor y podremos resolver tu duda con mayor eficacia.

No se si es lo que tú dices, pero si tratas de cambiar el orden de los Pokémon en la Pokédex en un momento específico de la partida, andas bien, porque no creo que se pueda hacer (a excepción de que alguien sepa hacerlo con ASM)

Lo suyo es poner los modificados en lugares "comunes" de la Pokédex, y luego poner esos 3 como iniciales. Puedes asignar como iniciales a 3 Pokémon cualesquiera, independientemente del número de la Pokédex que tenga.

La duda principal no es cambiar el orden de la pokedex, sino tener dos tipos de pokemons que ocupen el mismo lugar, osea, que al ser uno modificado no me aparezca como un pokemon diferente