Si activas o desactivas la flag del mini en el script el mini no te desaparecera.
Para ello tienes que usar los comandos hidesprite 0x(numero sprite) y showsprite 0x(numero sprite).
Aun asi no te olvides de activar o desactivar las flags para que cuando entres en el mapa el mini este o no este visible.
Creo que no me he explicado bien, sino preguntame.