Bueno, viendo que te ocurre en todos los mapas, esto me huele a crujida, osea, te cargaste el rom, la causa más probable es por esos mapas nuevos que agregaste. Tal vez deberías esperar a ver qué dicen los demás, pero de todas formas te aconsejo que no emplees esta opción, ya que cosas como estas suelen pasar (básicamente sobreescribes algún dato importante y aparecen fallos a troche y moche).

El mejor consejo que puedo darte es que cojas alguna copia de seguridad del rom, la más reciente, y vayas aplicando los cambios que hiciste en el anterior, pero un detalle importante, ve guardando cada vez que hagas el más mínimo cambio en el rom, será mucho más seguro y, si vuelve a ocurrir (cosa que dudo), sabrás con qué cambios provocaste el bug.