Lo que postée primeramente lo he solucionado.
Ahora el problema es que me sale en blanco y negro en el lado izquierdo , y a la hora de pintar el mapa igual, pero se pinta bien.
Duda de novato, supongo.
Bueno, la cosa es que cambié los tilesets en el mapa en la parte del cabezal del mapa.
Cargué un tileset cuyo espacio creé manualmente por medio de tutoriales aquí.
Luego le di al 'puzzle' y cargué una imagen tilesets con tamaño y colores correctos, así como su paleta, y de maravilla.
El problema viene cuando el tileset de la izquierda en blanco, no me compila que le pase mis dibujos del tileset importado que era imagen...
(No estoy seguro si es fallo de compilación pero me da error al guardar los tiles dibujados para el tileset de la izquieda)