En el 05 se debería ejecutar igual que en el 03 al entrar al mapa, ya que ambos se ejecutan al cargar, con la diferencia de que el 05 también se ejecuta al entrar a algún menú o después de una batalla.
Lo que no entiendo es eso de que los minis van por libre, y aparecen donde quieren. Deberían aparecer en el lugar que los hayas puesto en A-MAP, si aparecen en otro sitio, debe haber algún script interfiriendo.
¿Cuántos scripts de nivel tienes en ese mapa y de qué tipo son cada uno?