Es justo lo que dice sayer, habrás insertado tiles encima de los tiles animados del tileset 0, y al verlos en vba se ven las animaciones de éstos. Una solución es esa, eliminar las anims y hacerlas de nuevo.
Pero yo te recomiendo que dejes las anims del tileset 0 donde están, y cambies la distribución de tus nuevos tiles en el tileset para que no estén encima de las anims.
Aunque también puedes editar las anims desde anim-ed y cambiarlas de sitio, pero sin eliminarlas, ya que es improtante tener la anim de agua, rocas de agua, flor, etc.
Por supuesto, también puedes eliminarlas todas y hacerlas tu de 0 a tu manera, mas pesado de hacer pero ganas puntos en "estilo", no se si me sigues xD
PD: Good map ;P