1- ¿Se puede poner la textbox arriba de la pantalla?

¡Si!

Si es así, ¿Cómo se hace?

con ésto:
writebytetooffset 0x0070 0x04000012
msgbox ....

¿Puede haber una textbox arriba y otra abajo?
Al mismo tiempo, con ASM, no se me ocurre otra forma. (Por ahí anda una rutina así, en PC)

Si no es al mismo tiempo, osea, primero una, luego otra, la cambias de aparecer arriba a abajo...

(Todo esto del WBTO (writebytetooffset) es del I/O mas que nada, si no sabes de él, te recomiendo mi tutorial: Investigar I/O y ésta investigación: Link!

2- ¿Como se hace para que en un script desaparezca el mini del protagonista?

¿Probaste hidesprite 0xFF? Nunca lo intente, pero debería funcionar xD