Agradezco mucho la colaboración de todos. He seguido las instrucciones de Landey (lo de los offsets puede que lo haga después, que tengo que leerme un tutorial acorde para hacerlo manualmente), la cosa es que realmente se ha arreglado el tema de las conexiones y el juego ya no se cuelga. Parece que no había roto el ROM después de todo... xD

Sin embargo ha surgido un nuevo problema. Ahora, cuando voy a la ruta nueva y regreso al primer pueblo (lo que antes había sido Villa Raíz), algunos tiles se cambian y aparece una especie de glitch. Adjunto imagen para que veáis bien qué es lo que ocurre:



No sé si sepáis por qué pasa esto :s

Todavía me quedan algunos tiles por cambiar, pero los ponga como los ponga me ocurre esto cuando entro en el pueblo desde la ruta superior...