No es necesario el script de nivel.

Un detalle que aprendí viendo los mapas originales, si te fijas Sakura, los bloques que son de tileset secundarios, no están inmediatamente al entrar al mapeado o despues de una conexión, sino que están un poco mas alejados.

Esto es porque hay conflictos entre un tileset secundario y otro porque ambos se guardan en el mismo sector de la memoria RAM (que es la memoria temporal del "gameboy" o en nuestro caso del emulador).

Te recomiendo mapear este tipo de bloques a 6, 7 o más pasos de la conexión mas cercana hacia otra ruta.

Suerte!