Hola! bueno primero quiero decir que si hay forma de hacerlo pero no de la forma como pides

se puede hacerlo ponendo el sprite del prota(o otro personaje...) en tamaño 32x32 (o más)
y despues pones el pokemon atras del prota pero siempre usando 16 colores osea el pokemon tendra que ser basico(cabeza, cuerpo y pies?)...

bien solo hay esa forma por ahora...

bien espero tener ayudado!