Si tienes el lunar IPS el propio sistema debería reconocer el parche, con lo cual se podría aplicar el parche dando doble clic. Si no lo reconoce, tienes que abrir el lunar IPS y darle a "Apply IPS path".

Si lo haces de la primera forma (dando doble clic), se te abrirá una ventana donde debes seleccionar el rom parchear y listo.

Si lo haces de la otra (abriendo el lunar IPS), se abrirá una ventana donde deberás seleccionar el parche y, cuando lo selecciones, se te abrirá otra automáticamente para seleccionar el rom a parchear y listo.

El rom que debes parchear tiene que ser el rom base que es indicado en lugar de donde te bajas el hack. Normalmente es Ruby o Fire red en inglés.

Saludos!!