Creo que no me he explicado bien xD A ver... si la ROM está en español, es normal que no te salgan los marcadores, porque APE sólo trae por defecto (que yo sepa) los de las ROMS inglesas. Por eso tienes que añadirlos tú. En cambio, la persona que hizo el tutorial seguramente usaba la versión inglesa, y por eso los marcadores ya le salían solos.
Por otro lado, con lo de donde lo has descargado me refería a la herramienta, APE: si no me equivoco, has dicho que tienes el APE en inglés y que lo quieres en español (el programa, no la ROM). Y yo te digo que, si quieres el APE en español, puedes descargártelo en la web de WAH.
Suerte ;)