Mmm, vale.
Puede ser que hayas hecho algo mal.
1. No le distes a "Write palettes changes to rom" después de cambiar alguna paleta.
2. Agrandastes algun mapa.
3. Cambiastes alguna conexión entre pueblos mal
Soluciones:
1. En el block editor, dale a Palettes - Write palettes changes to rom
2. No tiene solución, usa alguna copia de seguridad o vuelve a empezar.
3. Arregla la conexión.