Vamos a ver, el problema es de paletas, así que te lo desmenuzaré algo más.

1. Saca la paleta del tile. Es decir abre el tile con el CMP y guarda la paleta, en formato *.act
2. Luego que cargas el tileset con el Adv. Map, carga la paleta del tile, esta paleta tiene que tener en primer lugar el color de fondo más 15 colores que deben ser distintos de 0, cárgala y dále a Write Pallete Changes to Rom.
3. Luego acomoda el tile a tu gusto y ya está.

Con esto debe quedarte el tile con sus perfectos colores.

Salu2.