¿Lo estás poniendo todo en bloqueo de paso y ya, cierto?
Con eso me refiero que no tengan prioridad ni cualquier otra cosa asignada, por ejemplo, si bloqueo el paso pero después le pongo un terreno como por ejemplo el de arena pues puedo pasar por encima.
P.D: El problema no es de tu versión, yo uso la misma que tú y no pasa nada, además, si usaras otra el Pokémon Essentials te daría error de incompatilibidad entre versiones.