Debes pensar que el RPG Maker te deja crear un juego desde cero, pero las cosas características de Pokémon como ataques, menús, descripciones de Pokémon en la Pokédex... están en inglés aunque se pueden traducir en el editor de Scripts,buscándolos en su sección correspondiente.

Cuando hagas por ejemplo el primer pueblo si hay un NPC en el pueblo y quieres que diga una frase, debes crear un evento en que el mini diga la frase, y esta puede ser la que quieras, en el idioma que quieras.