Bueno, las cosas no son tan simples como que uno sea mejor (ya que eso indicaría que el otro es peor lo cual no es cierto).
De preferencia, en todo uso, la base. En este caso "Pokemon Essentials" debido a que considero que tiene mas soporte/apoyo y hay mas artículos creados en Foros, etc. Puedes usar tambien el WaE que esta en español y tiene muy buena pinta. Los tutoriales del primero sirven generalmente con este.
Obviamente el PSP DS se ve genial, tiene "perspectiva" según leí. Por mi parte se parece una cuestion extraña emular la pantalla doble de la DS para un juego que se va a jugar en PC.