Engine es una palabreja que se empezó a usar en el RPG Maker en los tiempos de gloria de Hellsoft, una comunidad hispana de RPG Maker que mejor dicho fue la que se trajo el dichoso programa a estas costas (???). Ciertamente, engine se refiere no a un programa, sino a un motor de desarrollo (el programa en sí no es el engine, sino quizá más bien el RGSS, el programa es el IDE, o el editor más bien).
En comunidades inglesas al engine se le llama simplemente "eventing". Crear eventos y tal, porque eso es lo que se hace...

Conclusión, no le busquen tres patas al gato, se llama engine porque así le dicen xD,
Muramasa