Hombre, como poderse hacer... Supongo que sí se podría. El problema reside en la falta de herramienta e investigación en esos juegos. Es decir, esos juegos no se investigan (o por lo menos no mucho), por lo tanto no se crean herramientas para modificarlos.

Así que, sí se pueden modificar, sí, pero todo (o casi todo, no sé si existirá alguna herramienta) sería pura edición hexadecimal. Algo muy complicado en un rom que no conocemos...

Lo mejor si quieres hacer un juego de ese tipo, según mi opinión, es utilizar RPG Maker.