La verdad, ninguno. Solo compatibilidad con herramientas.
Hay herramientas que no son compatibles con algunos ROMs, siendo la mayoría compatibles para Ruby USA.
Pero la incompatibilidad son solo para herramientas más avanzadas, que pocas veces se usan y generalmente hay otra herramienta que hace la misma funcion.
Lo malo, es que la direcciones en UnzlGba cambian y no están anotadas.