Te recomiendo que te mires este tutorial:

http://wahackforo.com/t-aporte-codigos-pkm-ruby-movs-flags-especiales-etc

En una parte te dejan el codigo de la pokédex nacional junto a una explicación, lo editas y listo. Después solo debes insertarlo donde quieras conseguirla, como por ejemplo que te la de el profesor o algo, hacer que se tenga la pokédex nacional de principio principio creo que no se puede.

Un saludo.