Sobre las dudas de XSE. Deberías leer tutoriales para aprender a hacer applymovments. En Move it puedes confeccionar la lista de movimientos, pero a esos movimientos hay que llamarlos desde el script con el comando applymovement y haciendo uso del respectivo waitmovement para que todo salga bien. Te recomiendo, repito, leer un tutorial sobre scripts. Quizás algunas de las entregas de mi "macrotutorial" te sean de ayuda. Se explica también el applymovement. Respecto a la segunda duda, no la he entendido xD

En cuanto a mi herramienta. Se utiliza en un rom original de FR, no sé si se podrá utilizar en el rom de JPAN, no lo he intentado. Pero quizás estés compilando en algún sitio con datos y los estés sobrescribiendo. Respóndeme a las siguientes preguntas:

1) ¿Estás usando el rom de JPAN?
2) ¿En qué offset estás compilando?
3 ¿Qué errores te provoca en el rom al utilizar la herramienta?
4) ¿Has utilizado la opción para comprobar espacio de la herramienta?