Lo que yo pienso es que alomejor lo que podrías hacer algo rollo chekpokedex, es decir, si lo has visto, significa que has luchado con el. Por lo cual si aparece en la pokedex lucharias y si no pues no. Lo malo es que no se si se podría hacer eso con Script, o habrá que usar ASM. Pero bueno por lo menos he intentado darte una idea XD.