Es bastante fácil, mira:
#org @inicio
checkflag 0x*700
if 0x1 goto @*hecho
...
...
end
#org @ya
...
...
end

Ahora explicándolo xD:
#org @inicio (lo de siempre)
checkflag 0x700 (aquí comprobará algo de la flag 700, usa una libre, luego edito el mensaje.
if 0x1 goto @ya (arriba dije que comprobará algo, y comprobará si es cierta o no( que está activada o no) en mi caso, he puesto 0x1, así que si es cierta irá al pointer @ya. si quieres que pase eso si es falsa, pon 0x0.
Después ya lo de más...

#org @ya
...
...
...
Te ha quedado claro, no? xD
Salu2