Efectivamente, no puedes hacer un msgbox con un fadescreen porque este lo tapa.

Hay una muy buena opción que es con un writebytetooffset, lamentablemente, desconozco el byte y el offset xD. Estaba en wah! "2.0", ahora no tengo acceso a dicha información...

También hay un comando, "darken". Vuelve toda la pantalla en negro. El problema de eso es que debes hacerlo en un script de nivel y no sé si sabrás ya hacer ese tipo de cosas (no es un 02 - validates values, es el otro tipo además del setmaptile). Y, la verdad, no estoy seguro de que se vean los msgbox.

Vamos, resumiendo, pon en el tileset un nuevo bloque, este tiene que ser negro y configuralo para que tape al mini del protagonista. Luego haz un movesprite y un cambio de cámara instantáneo y listo, haces ahí el msgbox. Creo que es la mejor opción, de hecho, es la que siempre he usado, aun teniendo los datos necesairos para hacer el WBTO.

Bueno, si tienes alguna duda o no te sale, dilo ;D