No es nada grave. Has puesto todo el suelo con el tile de la entrada. Es decir, frente a una entrada sí va ese tile, por eso te sale esa flecha. Tiene que haber otro tile igual para el resto del suelo. Mira cuál es en otra cueva con el mapeado original del juego y ya está.
Lo que te pasa es que ese tile, como te digo, le corresponde a una entrada. Entonces te aparece la flecha porque el tile se comporta como un warp.