Pues es fácil, pero necesitas saber sobre scripting lo suficiente como para hacer un script de nivel validates value (ke no tiene ningun misterio)
El lugar donde empiezas es editable con el Advance IntroEd, pero tambien puedes usar la herramienta G-Latina, esta por wah. Con esas herramientas eliges el mapa inicial y varias cosas mas, como tu dinero inicial o el pokémon de oak/birch.

Luego, lo del script inicial, es tan fácil como poner un script de nivel en el mapa inicial tipo validates value, para que nada mas empezar, haya un script (por ejemplo en mi hack tambien usé eso).
Mírate los tutos de wah sobre los scripts de nivel e intentalo.
Cualkier problema, postea.
Un saludo ;)