Yo segui el tutorial de Cheve para insertar un tileset primario, y debo decir que funciono, todas las paletas, bloques, comportamientos de tiles y animaciones andan de joya, aunque obviamente el tileset manager no busca automaticamente offsets como a-map, pero igual funciona y no falla

Y sobre los mapas ¿Quien demonios se queda con los mapas originales? aunque puedes asignarle a cada mapa un tileset primario y secundario propio, es mejor no hacerlo considerando que esto ocupa mucho espacio.

PD: En serio, nunca dejaria que una herramienta tan poco fiable a la hora de repuntear y buscar espacio como a-map me inserte tilesets nuevos.